按照《中关村国家自主创新示范区产业发展资金管理办法》的要求，能源安全产业技术研究院成立平台公司进行独立运行，配备专职专业的工作人员及办公场所，主要部门有：

综合办公室

负责起草、修订能源安全产业技术研究院及平台公司的规章制度，拟定工作计划、工作要点和总结，对日常文件、会议、通知、印章等事务进行记录和处理，做好对外联络和接待，协调能源安全产业技术研究院与校内外单位的联系活动，协助处理中关村科技园区管理委员会下发的通知、文件并做好记录，负责联合共建研究机构的管理和运行考核，组织和协调与重点区域、重点企业的产学研合作及各类科技对接、洽谈活动，向社会推介与展示学校科技成果。

财务部

负责平台公司的财务、工商、税务、预算、结算及资产管理等工作，负责平台公司及各联合共建机构的财务监管、指导、核算、统计等工作，为公司经营、管理、投资、发展提供合理化建议。